Évolution de la maladie - Chances de guérison
Il n'existe à ce jour aucun traitement permettant de guérir l'EoE. Nous devons donc nous préparer à un traitement (à long terme) de l'EoE. Heureusement, rien n'indique pour l'instant que l'EoE augmente le risque de cancer de l'œsophage. Cependant, comme cette maladie est encore relativement récente, la vigilance reste de mise.
Dommages à long terme
Non traitée, l'inflammation chronique causée par l'EoE entraîne des lésions à long terme de l'œsophage, avec une limitation durable de sa fonction pouvant aller jusqu'à une perte fonctionnelle (voir ci-dessus sous...). De nombreux éléments indiquent que ces lésions peuvent être évitées grâce à un traitement rigoureux. Il est possible que certaines lésions puissent régresser, au moins partiellement, grâce à un traitement rigoureux.